大豆を納豆菌で発酵させた食品です。たんぱく質はもちろんのことミネラルやビタミンが豊富に含まれ、なかでも骨を作るのに不可欠なビタミンKやナットウキナーゼを含むことで注目されています。食物繊維は100グラム中に4.9～7.6グラムと豊富に含まれています。食物繊維はオリゴ糖などと共にプレバイオティクスと呼ばれ、腸内環境に有用な成分です。納豆菌はプロバイオティクスと呼ばれ、これも腸内環境に有用と考えられています。
納豆に含まれるレシチンは記憶力や学習能力を高め、血中コレステロールの低下による脂質異常症の予防、血圧低下作用による高血圧予防。たんぱく質は脳内の神経化学伝達物質の合成を活発化します。コリンは脳の神経化学伝達物質の材料となります。ビタミンB1は中枢神経と末梢神経の機能を保ちます。カルシウムは不足すると集中力が低下します。ビタミンKは脳の神経伝達を活性化します。カリウムは無気力を防ぐ。マグネシウムは高ぶった神経を鎮静化する。ジピコリン酸、リゾチームはO157病原性大腸菌、サルモネラ菌などの抗菌作用。イソフラボン、スーパーオキシドディスムターゼ(SOD)の抗酸化作用による生活習慣病予防のほか、健脳効果（神経伝達物質の活性化、血液循環の改善）、血栓溶解作用、骨形成促進作用、カルシウム吸収促進作用など多様な効果が知られています。
ビタミンK2は抗凝固薬（ワルファリン）の作用を弱めることからワルファリンの服用中は納豆の摂食は避けるべきです。
ナットウキナーゼは食べた後、10～12時間ほど効果があると言われていますので、夜に食べると脳梗塞を惹き起こす血栓の生産が抑制されると言われています。（近藤雅雄、2015年10月5日掲載）